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害虫综合治理研究室联合破译松墨天牛染色体水平基因组

发布时间:2024年02月27日 15:03  浏览次数:117

近日,我所害虫综合治理研究室联合北京林业大学、中国林业科学院共同破译了松墨天牛Monochamus alternatus染色体水平的基因组。研究论文发表于Nature Research旗下刊物Scientific Data。

松材线虫病是由松材线虫引起的毁灭性森林病害,松墨天牛是松材线虫病的重要媒介昆虫。该项研究利用Oxford Nanopore长片段测序、Illumina二代测序和高通量染色体构象捕获技术(Hi-C)对松墨天牛基因组进行了测序,组装得到大小为767.12 Mb,包括10条染色体的基因组,BUSCO评估完整度为99.7%。结构注释共鉴定到16,284个蛋白编码基因,其中11,244个基因可注释到功能,此外,在基因组中注释到了498个tRNA,107个rRNA基因。松墨天牛基因组的测序、组装和注释为进一步研究该虫发生规律与成灾机理,揭示松墨天牛与松材线虫的互作机制提供重要基础数据。

联合培养博士研究生高勇富为论文第一作者,北京市农林科学院魏书军研究员和北京林业大学宗世祥教授为文章的共同通讯作者。北京市农林科学院杨方园、宋威、沈修婧、曹利军、陈金翠,中国林业科学研究院曲良建研究员参与了该研究。相关工作得到了国家重点研发计划等项目的资助。

文章链接:https://doi.org/10.1038/s41597-024-03048-y

图:松墨天牛基因组评估(A)和Hi-C组装(B)结果

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